誕生樹，就是在孩子出生那天栽種的樹。在這個遙遠小山城，每個人都有一棵誕生樹，只得阿傑沒有──他爸爸那天太高興，忘了要種樹。有天，這個無樹的男孩遇見了小米，是跟他同一天生日的女孩，開始了一個關於樹的純真故事。

住在農村的他有三位樹朋友：木麻黃、榕樹和相思樹。哭泣時，他躺在樹朋友懷裡就得到安慰；開心時，爬到樹上就能望遠高歌；還有一位，總在風吹過時跟他輕聲低語。樹朋友陪他走過許多個春夏秋冬，多年以後，老家和樹朋友面臨被拆的命運，成長了的他還能維持跟樹的友誼嗎？

小綠總愛待在家裡閣樓，望著窗外那片樹林。層層疊疊的樹葉遮蔽了天空，形成一片獨特而神秘的綠。樹林裡有野花，有果子，還有各種動物的聲音，充滿生氣。這片樹林讓小綠自由自在，是他很喜歡的秘密基地。某天，大人將足跡踏進了這處，高樓跟著出現，小綠也不得不跟小樹林說再見。

小維和洛琳搬了家，新房子旁竟有座大花園，還種著幾株老樹。雖然庭園有些亂，但在爸爸的指導下，他們開始翻新庭園，學習耕種，親手翻土、澆水和除蟲，按著夢想中的花園藍圖，逐步建造出一座美麗的「城市庭園」。他們跟植物渡過四季的變化，還因此認識到新朋友呢。